Mosquera Polo ha centrado su investigación en la superconductividad teórica, publicando trabajos científicos de impacto sobre materiales superconductores y fenómenos relacionados. Además, es coautor del libro universitario Fundamentos de mecánica de fluidos: Con ejercicios parcialmente resueltos, que dirige a estudiantes de ingeniería y física, abordando hidrostática, hidrodinámica, viscosidad y otros temas de mecánica de fluidos.
Su carrera académica combina la docencia, la investigación científica y la producción editorial, con el objetivo de fortalecer la formación en física y promover la divulgación del conocimiento científico en Colombia.
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